RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ALPL	P05186	524 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	SOX2	P48431	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ZP1	P60852	638 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599		J3QRE1	110 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	CCRL2	O00421	344 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	HSD17B6	O14756	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFPL1	O95159	310 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	AMY1A	P04745	511 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	AMY2A	P04746	511 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	SSTR5	P35346	364 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	MYCNOS	P40205	109 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB40B	Q12829	278 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ING4	Q9UNL4	249 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PPI3	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	GABRP	O00591	440 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	THBS3	P49746	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PPE3	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	AP4M1	O00189	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	GZMH	P20718	246 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	REG1B	P48304	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	STPG2	Q8N412	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINA2	P20848	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	DGCR2	P98153	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	MED21	Q13503	144 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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