RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	THEM4	Q5T1C6	240 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CUTC	Q9NTM9	273 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624		A0A0G2JNG1	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	IL33	O95760	270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DS5	Q14953	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CYR61	O00622	381 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	EML2	O95834	649 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	WNT5A	P41221	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	GABRA2	P47869	451 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	IL24	Q13007	206 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CARF	Q8N187	725 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	OR5R1	Q8NH85	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PLPP3	O14495	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	MT-CO2	P00403	227 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CRYAA	P02489	173 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	COX5B	P10606	129 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	RTP5	Q14D33	572 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	MPPED1	O15442	326 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TOX4	O94842	621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CD38	P28907	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	DRD3	P35462	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	BLACE	A4D250	179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624		G3V3Y1	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PAGE4	O60829	102 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CXCL12	P48061	93 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	NAT6	Q93015	286 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	NRAS	P01111	189 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ZXDA	P98168	799 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ROM1	Q03395	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	P2RY6	Q15077	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	FAM60A	Q9NP50	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	LAMTOR5	O43504	91 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ZNF253	O75346	499 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	HRAS	P01112	189 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	OR5G3	P0C626	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	RAB31	Q13636	194 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	LTC4S	Q16873	150 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	CDS2	O95674	445 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PXN-222	ENST00000637624	ERG	P11308	486 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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