RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637325.1

PNKP-228, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-228	ENST00000637325	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CD34	P28906	385 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	BRS3	P32247	399 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	EFNB2	P52799	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	DOC2B	Q14184	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	LTC4S	Q16873	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		A0A1W2PP11	408 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	PEX14	O75381	377 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	IL1A	P01583	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MED22	Q15528	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		A0A087X0M5	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		A0A1B0GX30	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		H0YHG0	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	PIN1P1	O15428	100 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CGB3	P0DN86	165 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CGB7	P0DN87	165 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GZMH	P20718	246 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MNDA	P41218	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	PAX5	Q02548	391 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	SPHAR	Q15513	63 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	RPE	Q96AT9	228 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TMED9	Q9BVK6	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MMP27	Q9H306	513 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		J3QR06	171 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MYF6	P23409	242 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CD24	P25063	80 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	SSTR5	P35346	364 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	UFD1	Q92890	307 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	OR5M11	Q96RB7	305 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MMP28	Q9H239	520 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	BANF2	Q9H503	90 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	AIP	O00170	330 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	RGS10	O43665	173 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	CSF1	P09603	554 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	MGMT	P16455	207 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	GNG10	P50151	68 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	SLC35A2	P78381	396 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	UTF1	Q5T230	341 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PNKP-228	ENST00000637325	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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