RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SAXO1Q8IYX7 474 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51T1Q8NGJ9 327 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C3Q8NGS6 347 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 BARHL1Q9BZE3 327 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FLOT2Q14254 428 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK5R1Q15078 307 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OVCH2Q7RTZ1 564 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11H1Q8NG94 326 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2G2Q8NGZ5 317 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T10Q8NGZ9 312 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RASL11BQ9BPW5 248 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH7Q8WXX0 4024 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 HCKP08631 526 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SSTR5P35346 364 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFAND6Q6FIF0 208 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N9W7 124 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MBOAT4Q96T53 435 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 EBI3Q14213 229 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM27D1Q5T7N8 215 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF152Q8N8N0 203 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMAT4Q9H898 229 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV39A0A0B4J263 110 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-ND2P03891 347 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 INSL3P51460 131 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 GYS2P54840 703 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF85Q03923 595 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FHL3Q13643 280 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10AC1Q8NH08 325 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FRRS1LQ9P0K9 344 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8U8P0C7N1 319 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MTNR1BP49286 362 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ISL1P61371 349 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10A7Q8NGE5 316 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51A4Q8NGJ6 313 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RNFT2Q96EX2 444 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00574Q9H8X3 128 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM118AQ9NWS6 357 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV24A0A0B4J272 114 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHG4P01861 327 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ISG15P05161 165 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR1AP08908 422 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 T-ENOLP0DO92 83 aa21.35■■□□□ 1.01
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CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N6K4 173 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD7Q96MP8 289 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 S1PR3Q99500 378 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPB9Q9BQS6 159 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ISYNA1Q9NPH2 558 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MOSP00540 346 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN26Q16670 478 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LPCAT4Q643R3 524 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1N2Q8NGR9 330 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5B12Q96R08 314 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 IL3RAP26951 378 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX6P35712 828 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CFHR3Q02985 330 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 KISS1Q15726 138 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM65Q6PI78 240 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ENOPH1Q9UHY7 261 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZP1P60852 638 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF616Q08AN1 781 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF691Q5VV52 312 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF429Q86V71 674 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 RFKQ969G6 155 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 G3V2T6 193 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SAP30O75446 220 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5H8P0DN80 308 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB8P28062 276 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 CD1BP29016 333 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ3P48549 501 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 IL13RA2Q14627 380 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 UBALD1Q8TB05 177 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 GNB4Q9HAV0 340 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 PLSCR3Q9NRY6 295 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 DAPL1A0PJW8 107 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 TMED1Q13445 227 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGYQ3MUY2 71 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8H1Q8NGG4 311 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10K1Q8NGX5 313 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 EME1Q96AY2 570 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 GPER1Q99527 375 aa21.3■■□□□ 1
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