RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 HYPMO75409 117 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 EML2O95834 649 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RECKO95980 971 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 IL4P05112 153 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.57□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RAC3P60763 192 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF56Q15929 161 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 WDR38Q5JTN6 314 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 LDLRAD1Q5T700 205 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4A5Q8NH83 315 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PTP4A1Q93096 173 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PAGE4O60829 102 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MYH11P35749 1972 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SCAND1P57086 179 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ACER2Q5QJU3 275 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GPR82Q96P67 336 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TREM2Q9NZC2 230 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 JKAMPQ9P055 326 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 A8MWL6 223 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM106CPP0CH98 169 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CCL2P13500 99 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NUBP1P53384 320 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CTF1Q16619 201 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TUBA4BQ9H853 241 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM206AQ9NX38 181 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 C3P01024 1663 aa3.57□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 SLC25A20O43772 301 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CDK2AP2O75956 126 aa3.57□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 SRD5A2P31213 254 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CX3CL1P78423 397 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF117Q03924 483 aa3.57□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 C10orf128Q5T292 105 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.57□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.57□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 HOXA6P31267 233 aa3.56□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 SOX8P57073 446 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NXPH1P58417 271 aa3.56□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 MPV17LQ2QL34 196 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SPATA45Q537H7 98 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CFAP161Q6P656 301 aa3.56□□□□□ -1.84
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ANKRD28-215ENST00000624145 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR8G5Q8NG78 346 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 YIPF6Q96EC8 236 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 KIR2DL4Q99706 377 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SOSTQ9BQB4 213 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.56□□□□□ -1.84
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