RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 HRASP01112 189 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 FGF5P12034 268 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CTHP32929 405 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 LBX1P52954 281 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PAX5Q02548 391 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MPV17LQ2QL34 196 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF695Q8IW36 515 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM123Q8N131 208 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 FADS6Q8N9I5 356 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RELTQ969Z4 430 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 YPEL2Q96QA6 119 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 IMMP2LQ96T52 175 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 H3BML4 177 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 DLEU1O43261 78 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CHST1O43916 411 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CST7O76096 145 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 OMGP23515 440 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF92Q03936 586 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PIGYQ3MUY2 71 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF525Q8N782 197 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM18Q96B42 140 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 VSIRQ9H7M9 311 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 C5orf42Q9H799 3197 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 C2orf72A6NCS6 295 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM250H0YL14 139 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 M0R135 149 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 C1orf61Q13536 156 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM240Q5SV17 173 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF573Q86YE8 665 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 OR2M3Q8NG83 312 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 OR1L3Q8NH93 324 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF799Q96GE5 643 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 STRADBQ9C0K7 418 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MYOTQ9UBF9 498 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ANGPTL7O43827 346 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 NAPSAO96009 420 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 THEGLP0DJG4 465 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GABRG2P18507 467 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 BLKP51451 505 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CARD17Q5XLA6 110 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RAB40CQ96S21 281 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SYNGR3O43761 229 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SHBQ15464 509 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ATG101Q9BSB4 218 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PRSS50Q9UI38 385 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SLC22A20A6NK97 555 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 IFNA1P01562 189 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GLI4P10075 376 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GALR1P47211 349 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 LCN2P80188 198 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TECTBQ96PL2 329 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms