RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602251.5

LTBP4-231, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-231	ENST00000602251	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	CHST4	Q8NCG5	386 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	TCF19	Q9Y242	345 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	hADV38S2	A0JD32	116 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	FUOM	A2VDF0	154 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251		A6NDX4	124 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	MGST3	O14880	152 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	CDRT1	O95170	752 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	TMEM219	Q86XT9	240 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	PSPN	O60542	156 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	BLCAP	P62952	87 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	GPR176	Q14439	515 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-231	ENST00000602251	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CCL3L1	P16619	93 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SERPINA2	P20848	420 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LMO1	P25800	156 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MAP2K4	P45985	399 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LGALS4	P56470	323 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ERVFRD-1	P60508	538 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF273	Q14593	569 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TRAM1	Q15629	374 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	PLA1A	Q53H76	456 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ASCL4	Q6XD76	172 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TMEM203	Q969S6	136 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MGLL	Q99685	303 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF728	P0DKX0	622 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OR3A1	P47881	315 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	P2RX3	P56373	397 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GABARAPL2	P60520	117 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CDH26	Q8IXH8	852 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OSR2	Q8N2R0	312 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MUL1	Q969V5	352 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF714	Q96N38	554 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ING3	Q9NXR8	418 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	IL36G	Q9NZH8	169 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LYST	Q99698	3801 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GTF2F2	P13984	249 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	AES	Q08117	197 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TPBG	Q13641	420 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	IL13RA2	Q14627	380 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	INSL4	Q14641	139 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	PIGY	Q3MUY2	71 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	AWAT2	Q6E213	333 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251		Q6P435	159 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SVOP	Q8N4V2	548 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	DPF1	Q92782	380 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	HSPB6	O14558	160 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CPE	P16870	476 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	COX7A1	P24310	79 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		14.74	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms