RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CD74	P04233	296 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	SPN	P16150	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CD80	P33681	288 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R19	P59542	299 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	BTG1	P62324	171 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	COL10A1	Q03692	680 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	SIRPB1	O00241	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GPR37	O15354	613 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	DIRAS3	O95661	229 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MT-ND4	P03905	459 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TK1	P04183	234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	FCGR3A	P08637	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GIF	P27352	417 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	OR3A1	P47881	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	DSCR9	P59020	149 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GMFB	P60983	142 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	IL13RA1	P78552	427 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CR1L	Q2VPA4	569 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	NDUFS8	O00217	210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GABRA2	P47869	451 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R46	P59540	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF525	Q8N782	197 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392		Q9N2K0	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GYPA	P02724	150 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GZMH	P20718	246 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	SLC6A1	P30531	599 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MEF2D	Q14814	521 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GRK1	Q15835	563 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CARTPT	Q16568	116 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	CADM3	Q8N126	398 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	FAM168A	Q92567	244 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CELF4-222	ENST00000601392	DYRK2	Q92630	601 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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