RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCL3L1P16619 93 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARF6P62330 175 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PAX5Q02548 391 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OR4K15Q8NH41 348 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MCFD2Q8NI22 146 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC107Q8WV48 283 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ONECUT1Q9UBC0 465 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A0G2JMP0 313 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A0X1KG70 313 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 hADV38S2A0JD32 116 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FUOMA2VDF0 154 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APOA1P02647 267 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERVFRD-1P60508 538 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDNFQ49AH0 187 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LAX1Q8IWV1 398 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OR13A1Q8NGR1 328 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CMTM3Q96MX0 182 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DIABLOQ9NR28 239 aa16.1■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.09■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCGNO76038 276 aa16.09■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PAX8Q06710 450 aa16.09■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MADCAM1Q13477 382 aa16.09■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.09■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LINC00312Q9Y6C7 94 aa16.09■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM25AB3EWG3 89 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM25CB3EWG5 89 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM25GB3EWG6 89 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF260Q3ZCT1 412 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 Q6ZPA2 131 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GAPTQ8N292 157 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.08■□□□□ 0.17
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A0A6YYH2 397 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM235A6NFC5 223 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A6NJ64 397 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 XRCC3O43542 346 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AVPP01185 164 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTHLHP12272 177 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GLP1RP43220 463 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DLX1P56177 255 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OR6C3Q9NZP0 311 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.08■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CA11O75493 328 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NAPSAO96009 420 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GATA3P23771 443 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DLX6P56179 175 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM69Q5SWH9 247 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C11orf42Q8N5U0 333 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 Q8N7P7 452 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CORO2AQ92828 525 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF714Q96N38 554 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SERPINE3A8MV23 424 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF728P0DKX0 622 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAS2R20P59543 309 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF565Q8N9K5 539 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIRPDQ9H106 197 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AUP1Q9Y679 476 aa16.06■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CGB3P0DN86 165 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CGB7P0DN87 165 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MMP9P14780 707 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SSTR5P35346 364 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARFRP1Q13795 201 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HACD4Q5VWC8 232 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UBALD1Q8TB05 177 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDFY2Q96P53 400 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MMP27Q9H306 513 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EXTL2Q9UBQ6 330 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OPN4Q9UHM6 478 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A1W2PPH5 198 aa16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MMP23AO75900 390 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms