RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		7.61	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFS8	O00217	210 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	SULT1C2	O00338	296 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFB3	O43676	98 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORC5	O43913	435 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	MT-ND4	P03905	459 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL7	P13232	177 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNJ3	P48549	501 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDDM3B	P56851	147 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMUG1	Q53HV7	270 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC107	Q8WV48	283 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	NINJ1	Q92982	152 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC32	Q9BV29	185 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF25	Q9UIL4	384 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBBP9	O75884	186 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	FCGR3A	P08637	254 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNT2	P09544	360 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	GDNF	P39905	211 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAPT	Q8N292	157 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIOX	Q9UGB7	285 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFITM3	Q01628	133 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIQK	Q629K1	86 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	SETD6	Q8TBK2	473 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFT46	Q9NQC8	304 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PQ09	198 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	VWC2L	B2RUY7	222 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	DTYMK	P23919	212 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	P2RX3	P56373	397 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAX5	Q02548	391 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR52W1	Q6IF63	320 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR8B2	Q96RD0	313 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	ODAM	A1E959	279 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	UPK1B	O75841	260 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	DSCR9	P59020	149 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q5PR19	223 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNAPC3	Q92966	411 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	BORCS5	Q969J3	196 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLN8	Q9UBY8	286 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP9	Q99996	3911 aa		7.59	□□□□□ -1.19
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576		H7C1Q1	480 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	HLA-DMA	P28067	261 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBX5	P45973	191 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTB	P60709	375 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTG1	P63261	375 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM16L	Q309B1	348 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	STEAP3	Q658P3	488 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOGA1	Q86XE5	327 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	BEST4	Q8NFU0	473 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEURL2	Q9BR09	285 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q9N2K0	584 aa		7.59	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV2-5	P01817	119 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMO4	P61968	165 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		7.58	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms