RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 LMO1P25800 156 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 BRS3P32247 399 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR3A4PP47883 348 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CCR9P51686 369 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 SCN1BQ07699 218 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 SPHARQ15513 63 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 Q6P435 159 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CORO2AQ92828 525 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.62□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 A0A087X0M5 115 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GX30 115 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 LEUTXA8MZ59 168 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 E9PI62 339 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 HSPB6O14558 160 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 LALBAP00709 142 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CSN2P05814 226 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 PTGFRP43088 359 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ZP1P60852 638 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CDK5R1Q15078 307 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 XAF1Q6GPH4 301 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR52W1Q6IF63 320 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 LEAP2Q969E1 77 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 KIRREL1Q96J84 757 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 NEK6Q9HC98 313 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 GLS2Q9UI32 602 aa9.61□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-7P01780 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 NFYBP25208 207 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MED22Q15528 200 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ZNF329Q86UD4 541 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OSR2Q8N2R0 312 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 FCGR1BQ92637 280 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PPI3 338 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 H3BUI4 141 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 TOR1AO14656 332 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OGG1O15527 345 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OCM2P0CE71 109 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CGB3P0DN86 165 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CGB7P0DN87 165 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CEACAM3P40198 252 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 GLP1RP43220 463 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ARHGDIBP52566 201 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R43P59537 309 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 NEDD8Q15843 81 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CCDC58Q4VC31 144 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 CHST4Q8NCG5 386 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 OR56B4Q8NH76 319 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 TOMM40LQ969M1 308 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MUL1Q969V5 352 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MGLLQ99685 303 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 KIF25Q9UIL4 384 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.59□□□□□ -0.87
CTIF-208ENST00000590422 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.58□□□□□ -0.88
CTIF-208ENST00000590422 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.58□□□□□ -0.88
CTIF-208ENST00000590422 FUOMA2VDF0 154 aa9.58□□□□□ -0.88
CTIF-208ENST00000590422 PSMB11A5LHX3 300 aa9.58□□□□□ -0.88
CTIF-208ENST00000590422 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.58□□□□□ -0.88
CTIF-208ENST00000590422 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.58□□□□□ -0.88
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