RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 MED28Q9H204 178 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf198Q9H425 327 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NIPAL2Q9H841 368 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9HAA7 133 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DIABLOQ9NR28 239 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP57Q9NU63 452 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT15Q9NV35 164 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MCUBQ9NWR8 336 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK11Q9UBX7 282 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NCKAP5O14513 1909 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0A6YYH2 397 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GVI7 797 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GGT3PA6NGU5 568 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NJ64 397 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM74A7A6NL05 159 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF724A8MTY0 619 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BSH0 61 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SULT1C2O00338 296 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFSF12O43508 249 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 EFNA2O43921 213 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CTAG2O75638 210 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CBR3O75828 277 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RBBP9O75884 186 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SCGNO76038 276 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 VAMP5O95183 116 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MPZL1O95297 269 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HPP00738 406 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C1QBP02746 253 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MT-ND4P03905 459 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 P04436 131 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL3P10147 92 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR2CP28335 458 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK1A1P48729 337 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 P2RY4P51582 365 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MLF1P58340 268 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC61GP60059 68 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTBP60709 375 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTG1P63261 375 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK10Q15131 360 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPT1Q15389 498 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX2Q16385 188 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LPAL2Q16609 132 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OTPQ5XKR4 325 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CARD17Q5XLA6 110 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPPEQ6ZT21 453 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ITFG2Q969R8 447 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PTX4Q96A99 478 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MED30Q96HR3 178 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAC1Q96KF2 57 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DDA1Q9BW61 102 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BEX2Q9BXY8 128 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51J1Q9H342 316 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM206AQ9NX38 181 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF222Q9UK12 451 aa3.45□□□□□ -1.86
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