RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM107A	O95990	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC2A1	P11166	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFI30	P13284	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR1E2	P47887	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPM6A	P51674	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CRYBA2	P53672	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNGT1	P63211	74 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MEST	Q5EB52	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OAF	Q86UD1	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q8N6K4	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RARRES2	Q99969	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DEFB4A	O15263	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF737	O75373	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NXPH2	O95156	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NPPA	P01160	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD74	P04233	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD14	P08571	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NPS	P0C0P6	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRKX	P51817	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AQP3	Q92482	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q96M85	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A0B4J203	849 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1W2PN81	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SOX15	O60248	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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