RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 IFNA5P01569 189 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IGHV1-46P01743 117 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TYMSP04818 313 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IL4P05112 153 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 GTF2F2P13984 249 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 NPY1RP25929 384 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MPV17P39210 176 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PFN3P60673 137 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ASB13Q8WXK3 278 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ESR2Q92731 530 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PTH2Q96A98 100 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IP6K3Q96PC2 410 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PEBP4Q96S96 227 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C1orf50Q9BV19 199 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 GLS2Q9UI32 602 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 KLK12Q9UKR0 248 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.3□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MYO15BQ96JP2 1530 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ATRNO75882 1429 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CLUHO75153 1309 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 F5H5T6 163 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 M0QYV0 167 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ISG15P05161 165 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CNTFRP26992 372 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ADORA1P30542 326 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CDKN2CP42773 168 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 INPP1P49441 399 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SPIN4Q56A73 249 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CENPWQ5EE01 88 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CST9Q5W186 159 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ERMNQ8TAM6 284 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 OR51B6Q9H340 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 VSIRQ9H7M9 311 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 BTRCQ9Y297 605 aa3.29□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PTPRKQ15262 1439 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C7orf66A4D0T2 115 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM210A6NLX4 147 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C21orf140B9A014 251 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TGOLN2O43493 480 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ARL6IP5O75915 188 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 OR5AC1P0C628 307 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC00614P0C842 121 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MLNP12872 115 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 HOXA6P31267 233 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 HAAOP46952 286 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB2AP61019 212 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC00483Q53H64 154 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF695Q8IW36 515 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 YIPF5Q969M3 257 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 TESCQ96BS2 214 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM60AQ9NP50 221 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 PARVAQ9NVD7 372 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.28□□□□□ -1.88
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A1W2PP64 1363 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 ACOX3O15254 700 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 CALB1P05937 261 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 PTHLHP12272 177 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 GADD45AP24522 165 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 MIPP30301 263 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 H2BFSP57053 126 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 DAD1P61803 113 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.27□□□□□ -1.89
PIK3C3-211ENST00000589550 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms