RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZPA2 131 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 BTN2A1Q7KYR7 527 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 C14orf79Q96F83 325 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 GAFA1Q96PS6 74 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 COL12A1Q99715 3063 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TRDCB7Z8K6 153 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF205O95201 554 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CTXN2P0C2S0 81 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DAOP14920 347 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A7Q99884 636 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KAAG1Q9UBP8 84 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB6O95139 128 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 F12P00748 615 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ERP29P30040 261 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 EFNA4P52798 201 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RAG2P55895 527 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 KRBOX4Q5JUW0 171 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF554Q86TJ5 538 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ2Q96H96 371 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 EHFQ9NZC4 300 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LRBAP50851 2863 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAT1Q6PIZ9 186 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNRF1Q8ND25 227 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMD4Q96H15 378 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP28Q9H239 520 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CHODLQ9H9P2 273 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DIRAS3O95661 229 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TFF1P04155 84 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKN1AP38936 164 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN5P62079 268 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DRB3P79483 266 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 AESQ08117 197 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 IDO2Q6ZQW0 420 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4A4PQ8NGN8 299 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL13Q99616 98 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP7O15540 132 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM33P57088 247 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf183Q5T699 404 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB1CQ92928 201 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 UPRTQ96BW1 309 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT15Q9NV35 164 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF25Q9UIL4 384 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS2O15393 492 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV2-70P01814 119 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTT2P0CG29 244 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GLCCI1Q86VQ1 547 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM185AQ8NFB2 350 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL19Q99731 98 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNIP1Q9NZI2 227 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 USF3Q68DE3 2245 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MEIKINA0A087WXM9 373 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5H8P0DN80 308 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6F1Q8NGZ6 308 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TERB2Q8NHR7 220 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM246Q9BRR3 403 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GINS4Q9BRT9 223 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf85Q9H1P6 137 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN4Q9UHM6 478 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB10Q9UN67 800 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LYNX1G3V0Z9 82 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LYNX1P0DP58 116 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ECI1P42126 302 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GLP1RP43220 463 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RX3P56373 397 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGN3Q15651 99 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS11Q6UWP2 260 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LURAP1Q96LR2 239 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ING3Q9NXR8 418 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DHFRP00374 187 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 H2AFB2P0C5Z0 115 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CR1LQ2VPA4 569 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 LHFPL1Q86WI0 220 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM216BQ8N7L0 139 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC107Q8WV48 283 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CABLES2Q9BTV7 478 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6C3Q9NZP0 311 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GVG6 124 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ODAMA1E959 279 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM20O43506 726 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 GLIPR1P48060 266 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM155Q4W5P6 130 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13C8Q8NGS7 320 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB3A2Q96PL1 93 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM18A8MTB9 384 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SCTP09683 121 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 GZMHP20718 246 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 EDDM3AQ14507 147 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC10Q5BKY1 277 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC22Q8N966 263 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF565Q8N9K5 539 aa25.81■■□□□ 1.72
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