RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	SRPX	P78539	464 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743		Q9N2K0	584 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	WRB	O00258	174 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	PAX9	P55771	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	CLDN15	P56746	228 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	ID3	Q02535	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A096LPE4	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BK	O60814	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	TRGC2	P03986	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BO	P23527	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BB	P33778	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BD	P58876	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BC	P62807	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	HLA-H	P01893	362 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	VDAC1	P21796	283 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	OR51H1	Q8NH63	302 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	WDR54	Q9H977	334 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	GJE1	A6NN92	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC34A2	O95436	690 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	TVP23C	Q96ET8	276 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	VSIR	Q9H7M9	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	NAPSA	O96009	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	UCP1	P25874	307 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	PLA2G5	P39877	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	MLF1	P58340	268 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ZFP92	A6NM28	416 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB11A	P62491	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	PRDX4	Q13162	271 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ATP5S	Q99766	215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	LY86	O95711	162 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	SOD3	P08294	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	FGF5	P12034	268 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24

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