RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 NSG2Q9Y328 171 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF175Q9Y473 711 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 A0A0A6YYD4 124 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 K7EPK0 472 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LMX1BO60663 402 aa6.89□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 TK1P04183 234 aa6.89□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 SLC2A1P11166 492 aa6.89□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 TGFBR3Q03167 851 aa6.89□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 ZNF266Q14584 549 aa6.89□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.88□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 PKIBQ9C010 78 aa6.88□□□□□ -1.31
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GGA3-218ENST00000584243 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 STARD10Q9Y365 291 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.87□□□□□ -1.31
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