RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560207.1

RABGGTA-215, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-215ENST00000560207 SERPINB10P48595 397 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 UBE2E1P51965 193 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 CTF1Q16619 201 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 IDNKQ5T6J7 187 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 MZT2AQ6P582 158 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 COQ2Q96H96 371 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 DIABLOQ9NR28 239 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 SPINT2O43291 252 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 CLPXO76031 633 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 MT-ND4P03905 459 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 TFF1P04155 84 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 GLIPR1P48060 266 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 VEGFCP49767 419 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 CLDN12P56749 244 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 RIPPLY3P57055 190 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 VBP1P61758 197 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 PITPNAQ00169 270 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 Q3ZCU0 254 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 MIDNQ504T8 468 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 OR10K2Q6IF99 312 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 TNFRSF14Q92956 283 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 RAB3CQ96E17 227 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 TBX15Q96SF7 602 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 KIF25Q9UIL4 384 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 HSPB6O14558 160 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 AVPP01185 164 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 IGHV1-69P01742 117 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 EPHA1P21709 976 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 DLX6P56179 175 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 NCS1P62166 190 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF273Q14593 569 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 FGFRL1Q8N441 504 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 Q8N7P7 452 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A087X0M5 115 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1B0GX30 115 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 RAB27BO00194 218 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 TPPPO94811 219 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 DIRAS3O95661 229 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 CD3GP09693 182 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 CGB3P0DN86 165 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 CGB7P0DN87 165 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 CD34P28906 385 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 GLP1RP43220 463 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 PRRX1P54821 245 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 LGALS4P56470 323 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF596Q8TC21 504 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTA-215ENST00000560207 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms