RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OR5AC1P0C628 307 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SFTA3P0C7M3 94 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 MDP1Q86V88 176 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 DTD1Q8TEA8 209 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CLN8Q9UBY8 286 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CXorf1O96002 111 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SELENOTP62341 195 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FDX2Q6P4F2 183 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 P2RX3P56373 397 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 STPG3Q8N7X2 389 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF714Q96N38 554 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 COL4A5P29400 1685 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAM106CPP0CH98 169 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PGA4P0DJD7 388 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 LIMS1P48059 325 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 AMTP48728 403 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM54Q969K7 222 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PR77 199 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 K7N7A8 449 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf128Q5T292 105 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 H0Y980 276 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FFAR1O14842 300 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GNG7O60262 68 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 GALR1P47211 349 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAM74A7A6NL05 159 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SEC11BP0C7V7 166 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 UCP2P55851 309 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 COA4Q9NYJ1 87 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ICMTO60725 284 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAM87AP0C7U9 286 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 NAAAQ02083 359 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 KCNMB1Q16558 191 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ST3GAL2Q16842 350 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PI3P19957 117 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 HERVK_113P61574 105 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAM209BQ5JX69 171 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 BATF2Q8N1L9 274 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 KCNK17Q96T54 332 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 COX6A1P12074 109 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CCKARP32238 428 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 SERF2P84101 59 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PARP11Q9NR21 331 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 VAX2Q9UIW0 290 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GVG6 124 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TMPRSS2O15393 492 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 AREGP15514 252 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 COX7A1P24310 79 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PRDX2P32119 198 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RAB32Q13637 225 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PGA5P0DJD9 388 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 PDLIM4P50479 330 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 TFF2Q03403 129 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 FHL5Q5TD97 284 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OR8G5Q8NG78 346 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 JPT1Q9UK76 154 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OR2W5A6NFC9 320 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 IQCJQ1A5X6 159 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-208ENST00000550358 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms