RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 ZP1P60852 638 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 RNFT2Q96EX2 444 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 GABARAPL3Q9BY60 117 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR4C45A6NMZ5 311 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 AP4M1O00189 453 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 HSD17B6O14756 317 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ZSCAN26Q16670 478 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 DEFB136Q30KP8 78 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 C9orf66Q5T8R8 295 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ZNF691Q5VV52 312 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR8U1Q8NH10 309 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 PELI1Q96FA3 418 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 C4orf36Q96KX1 117 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ASCL2Q99929 193 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 GON7Q9BXV9 100 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 LINC00574Q9H8X3 128 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 J3QRE1 110 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 CCRL2O00421 344 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 SULT1B1O43704 296 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 SSTR5P35346 364 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ECI1P42126 302 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 GPR12P47775 334 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 REG1BP48304 166 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 EBI3Q14213 229 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 LPCAT4Q643R3 524 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ELP2Q6IA86 826 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 MPZL2O60487 215 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ZFPL1O95159 310 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 FCGR1AP12314 374 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 GPR50Q13585 617 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 IL13RA2Q14627 380 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 KIR2DS1Q14954 304 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 SATL1Q86VE3 508 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ACBD7Q8N6N7 88 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 PXT1Q8NFP0 134 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 GPER1Q99527 375 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 ABCG5Q9H222 651 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-214ENST00000548849 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 C3orf84H3BNL1 204 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 MAGEB3O15480 346 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 KCNJ3P48549 501 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 RSU1Q15404 277 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 PIGYQ3MUY2 71 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 Q8N9W7 124 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 DHDHQ9UQ10 334 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 GABRPO00591 440 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 HTR3BO95264 441 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 ELANEP08246 267 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 FOXE3Q13461 319 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 KLHL22Q53GT1 634 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 LHFPL3Q86UP9 236 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 IZUMO1Q8IYV9 350 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 SUMF2Q8NBJ7 301 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 ALG8Q9BVK2 526 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 SNTNA6NMZ2 147 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 RPSAP08865 295 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-214ENST00000548849 RAB3AP20336 220 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms