RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLPP3O14495 311 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSD17B6O14756 317 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 DPM1O60762 260 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 KERAO60938 352 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDH16O75309 829 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 EEDO75530 441 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 FCN3O75636 299 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CIAO1O76071 339 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 MBD3O95983 291 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 MT-ND4P03905 459 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARG1P05089 322 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 DESP17661 470 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTNP21246 168 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPRR1BP22528 89 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 HLA-DMBP28068 263 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSMB6P28072 239 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 GNA11P29992 359 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 HOXA6P31267 233 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 P2RY1P47900 373 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NDUFA8P51970 172 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RWDD2BP57060 319 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUCB1Q02818 461 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 PNOCQ13519 176 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDK2Q15119 407 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 QPRTQ15274 297 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 LINC01554Q52M75 96 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 C9orf135Q5VTT2 229 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NIPAL3Q6P499 406 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 C11orf88Q6PI97 169 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLEC19AQ6UXS0 136 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 WDR88Q6ZMY6 472 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q6ZQT7 251 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC121Q6ZUS5 278 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 APRG1Q8IVJ8 170 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARL17AQ8IVW1 177 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 BBS7Q8IWZ6 715 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ORMDL3Q8N138 153 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q8N2B8 174 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPRMLQ8N4K4 120 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NPWQ8N729 165 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR10R2Q8NGX6 335 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZFAND1Q8TCF1 268 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 C7orf34Q96L11 122 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NSMCE2Q96MF7 247 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 MS4A4EQ96PG1 132 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 TESK2Q96S53 571 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDCA4Q9BXL8 241 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHST5Q9GZS9 411 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ECT2Q9H8V3 914 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLN8Q9UBY8 286 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 AURKCQ9UQB9 309 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 NOS1P29475 1434 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 A2ML1A8K2U0 1454 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A1B0GU33 70 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBFOX3A6NFN3 312 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM212A6NML5 194 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEC14L6B5MCN3 397 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 H3BNG1 76 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SDHDO14521 159 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 DYNC1I1O14576 645 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SGCEO43556 437 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 LYPLA2O95372 231 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CNIH1O95406 144 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGF2P01344 180 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGHV2-5P01817 119 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 C2P06681 752 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SOD3P08294 240 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 GRPRP30550 384 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD70P32970 193 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 FDFT1P37268 417 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 GRIA1P42261 906 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC1A2P43004 574 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 INSL3P51460 131 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAB25P57735 213 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPAG1Q07617 926 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 TOMM20Q15388 145 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 TGFBIQ15582 683 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAPK14Q16539 360 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGKV1-22-201ENST00000524313 CFAP157Q5JU67 520 aa-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms