RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF404Q494X3 552 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZSR6 202 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 SLC35G3Q8N808 338 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 SLC35B4Q969S0 331 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 OR4K3Q96R72 315 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TIMM17AQ99595 171 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 GLS2Q9UI32 602 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.29□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.28□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SUPT3HO75486 399 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PRTN3P24158 256 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB25P24278 435 aa3.28□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP10-8P60410 259 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 HPCAP84074 193 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PNOCQ13519 176 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PYCR3Q53H96 274 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CENPWQ5EE01 88 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 OTPQ5XKR4 325 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PRNTQ86SH4 94 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DCUN1D4Q92564 292 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 FXYD5Q96DB9 178 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CEP170P1Q96L14 293 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00167Q96N53 147 aa3.28□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 NACADO15069 1562 aa3.28□□□□□ -1.88
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PDE4D-215ENST00000506510 VWA8A3KMH1 1905 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 M0QYV0 167 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-215ENST00000506510 GTF2F2P13984 249 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 OR1E2P47887 323 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 TAS2R41P59536 307 aa3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-215ENST00000506510 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-215ENST00000506510 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-215ENST00000506510 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-215ENST00000506510 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 MDP1Q86V88 176 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.27□□□□□ -1.89
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PDE4D-215ENST00000506510 OR4X1Q8NH49 305 aa3.27□□□□□ -1.89
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