RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 H7C1Q1 480 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 HS3ST1O14792 307 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2H2O95918 312 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 GRPP07492 148 aa9.12□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 UQCRFS1P47985 274 aa9.12□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 OR8H3Q8N146 312 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 TOMM40LQ969M1 308 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 C18orf12Q96KH6 178 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.12□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 PIGMQ9H3S5 423 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.12□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 MAST4O15021 2626 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 A1L4Q6 167 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 LEUTXA8MZ59 168 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2D1BO14796 132 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL2L11O43521 198 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 DIRAS3O95661 229 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 TK1P04183 234 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXB5P09067 269 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5AC1P0C628 307 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF250P15622 560 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 GNLYP22749 145 aa9.11□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF83P51522 516 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 HERV-K104P61576 105 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DRB3P79483 266 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.11□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR7Q8TB68 274 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 NEK7Q8TDX7 302 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.11□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 SYT3Q9BQG1 590 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF25Q9UIL4 384 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 GTF3C1Q12789 2109 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JNJ9 132 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 SIRPB1O00241 398 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPB6O14558 160 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 MPPED1O15442 326 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-13P01766 116 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF44P15621 663 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 ESCO2Q56NI9 601 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-209ENST00000504450 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR82Q6UXN9 313 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 LGI3Q8N145 548 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 MED9Q9NWA0 146 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-209ENST00000504450 JKAMPQ9P055 326 aa9.1□□□□□ -0.95
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