RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500704.6

USP45-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP45, Length 5,826 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP45-208	ENST00000500704	NGFR	P08138	427 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	HOXC6	P09630	235 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	CD38	P28907	300 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MAGEA5	P43359	124 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	RGR	P47804	291 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	UCN	P55089	124 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	YAF2	Q8IY57	180 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PGBD5	Q8N414	524 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	RNF149	Q8NC42	400 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ACER1	Q8TDN7	264 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	GPR82	Q96P67	336 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MGST2	Q99735	147 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	GREM2	Q9H772	168 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR51F1	A6NGY5	319 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704		A8MWV9	139 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PIRT	P0C851	137 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MST1	P26927	711 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	HERVK_113	P61574	105 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	TMEM25	Q86YD3	366 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	NEUROG1	Q92886	237 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	C20orf173	Q96LM9	149 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR10A2	Q9H208	303 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	LYRM4	Q9HD34	91 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	C5AR2	Q9P296	337 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	DUSP13	Q9UII6	198 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	JPT1	Q9UK76	154 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MYO7A	Q13402	2215 aa		2.58	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	FNDC10	F2Z333	226 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704		J3KTA2	159 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	TMPRSS2	O15393	492 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	C1QL1	O75973	258 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SLC2A10	O95528	541 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ORM1	P02763	201 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	FCGR3A	P08637	254 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	GPX2	P18283	190 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ALOX5AP	P20292	161 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	EVI2A	P22794	236 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	MFAP5	Q13361	173 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OLIG2	Q13516	323 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SGCB	Q16585	318 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PSMG4	Q5JS54	123 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	PP6455	Q8WZ26	134 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	DIO2	Q92813	273 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	CALHM2	Q9HA72	323 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ASPDH	A6ND91	283 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	NUDT14	O95848	222 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	IL18BP	O95998	194 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SNHG28	P0DPA3	235 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	FUT6	P51993	359 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	CLDN15	P56746	228 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ZNF585B	Q52M93	769 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	LILRA6	Q6PI73	481 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		2.57	□□□□□ -2
USP45-208	ENST00000500704	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		2.57	□□□□□ -2

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