RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 DDI2Q5TDH0 399 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 SYS1Q8N2H4 156 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 TOMM40LQ969M1 308 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM106AQ96A25 262 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 GLS2Q9UI32 602 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 A0A087X0M5 115 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GX30 115 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM212A6NML5 194 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 C15orf65H3BRN8 121 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 IL1AP01583 271 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PF4V1P10720 104 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RAB3AP20336 220 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 MTNR1BP49286 362 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRR20EP86478 221 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRR20CP86479 221 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRR20DP86480 221 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRR20BP86481 221 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRR20AP86496 221 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RAB40BQ12829 278 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 DEFB136Q30KP8 78 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ELP2Q6IA86 826 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf88Q6PI97 169 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR9G1Q8NH87 305 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF596Q8TC21 504 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 CYGBQ8WWM9 190 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 MUL1Q969V5 352 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 BANF2Q9H503 90 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 XPNPEP2O43895 674 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.03□□□□□ -1.28
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HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM11P17152 192 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 BRS3P32247 399 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF134P52741 427 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 LOXL3P58215 753 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 GNMTQ14749 295 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR52W1Q6IF63 320 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ASCL4Q6XD76 172 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 MOB3BQ86TA1 216 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OSR2Q8N2R0 312 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PRR18Q8N4B5 295 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM104Q8NE00 496 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PXT1Q8NFP0 134 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR4K15Q8NH41 348 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR52N1Q8NH53 320 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR1L1Q8NH94 360 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 GGHQ92820 318 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 GHSRQ92847 366 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RPEQ96AT9 228 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 RITA1Q96K30 269 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR14A2Q96R54 314 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 OR4F4Q96R69 305 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2QL1A1L167 161 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC3-211ENST00000491581 PSMB11A5LHX3 300 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC3-211ENST00000491581 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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