RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 RDH5Q92781 318 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TCEAL3Q969E4 200 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SPSB4Q96A44 273 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 Q9N2K0 584 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 A0A1W2PPE3 182 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SLC22A20A6NK97 555 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PROB1E7EW31 1015 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 H3BP45 60 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 CHST1O43916 411 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 CDS2O95674 445 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 IGHEP01854 428 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SERPINA7P05543 415 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 EPHA1P21709 976 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 RAB5CP51148 216 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 OR2B8PP59922 312 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 RAB1AP62820 205 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 RUNX1Q01196 453 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 C3AR1Q16581 482 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 VASH2Q86V25 355 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 MKXQ8IYA7 352 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 OR51H1Q8NH63 302 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TECTBQ96PL2 329 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 NCOR1O75376 2440 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 K7N7A8 449 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 WRBO00258 174 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 LILRA1O75019 489 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM50AO95807 157 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 NAPSAO96009 420 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 MT-ND4LP03901 98 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 MAGEA5P43359 124 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SULT1A1P50225 295 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 DYNLT3P51808 116 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 FGF12P61328 243 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SRPXP78539 464 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF266Q14584 549 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ODF1Q14990 250 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 HAGHQ16775 308 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PRR18Q8N4B5 295 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 GLRX2Q9NS18 164 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.68□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TECTAO75443 2155 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 B9A039 149 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 HSPA12AO43301 675 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 NEURL1O76050 574 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SYNGR4O95473 234 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 FBP1P09467 338 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF806P0C7X5 589 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 JMJD7P0C870 316 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 LHX2P50458 406 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 UCP2P55851 309 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF154Q13106 437 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 OR2M7Q8NG81 312 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 UBALD1Q8TB05 177 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM56Q96MV1 263 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SPIN2AQ99865 258 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 RNF122Q9H9V4 155 aa5.67□□□□□ -1.5
RAD51B-210ENST00000487270 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms