RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486429.1

CLDN11-206, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 998 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-206ENST00000486429 NFYBP25208 207 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 KIR2DS4P43632 304 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 AWAT2Q6E213 333 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM219Q86XT9 240 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CDH26Q8IXH8 852 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 KIRREL1Q96J84 757 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 A0A087X0M5 115 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 A0A1B0GX30 115 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 H0YHG0 523 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 IGLV1-47P01700 117 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MYF6P23409 242 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 ARHGDIBP52566 201 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 EFNB2P52799 333 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SLC35A2P78381 396 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SPHARQ15513 63 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MED22Q15528 200 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 NEK7Q8TDX7 302 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SGCDQ92629 289 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 OR5M11Q96RB7 305 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 LEUTXA8MZ59 168 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CGB3P0DN86 165 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CGB7P0DN87 165 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SSTR5P35346 364 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CEACAM3P40198 252 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 OR9G1Q8NH87 305 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TMED9Q9BVK6 235 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MEGF11A6BM72 1044 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 BRS3P32247 399 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 HSPA13P48723 471 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 PRRX1P54821 245 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 INSL4Q14641 139 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 IRF3Q14653 427 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 ZNF702PQ9H963 129 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 H3BUI4 141 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 RGS10O43665 173 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MGMTP16455 207 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 LTC4SQ16873 150 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 UTF1Q5T230 341 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 Q6ZTK2 550 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 LYPD6Q86Y78 171 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 UFD1Q92890 307 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 MMP28Q9H239 520 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 DUSP21Q9H596 190 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 GPR50Q13585 617 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 HERPUD1Q15011 391 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 RFESDQ8TAC1 157 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 PHYHIPQ92561 330 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 BANF2Q9H503 90 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN11-206ENST00000486429 VWFP04275 2813 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 OOSP1A8MZH6 123 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 AIPO00170 330 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 IGHV3-7P01780 117 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms