RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485943.1

USP40-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 4

Gene USP40, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-216ENST00000485943 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.61□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 V9GY05 133 aa6.61□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.61□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 IGKV1D-12P01611 117 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 C3orf56Q8N813 242 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 UBE2QL1A1L167 161 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 HTR1DP28221 377 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 CCDC107Q8WV48 283 aa6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 RPEQ96AT9 228 aa6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 CALYQ9NYX4 217 aa6.59□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 GNG12Q9UBI6 72 aa6.59□□□□□ -1.35
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