RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	OXA1L	Q15070	435 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	THRSP	Q92748	146 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	COQ2	Q96H96	371 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RRH	O14718	337 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	OR2C1	O95371	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CD14	P08571	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	C4BPB	P20851	252 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TFPI2	P48307	235 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	MED21	Q13503	144 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TXNL1	O43396	289 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NUDT3	O95989	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CHEK2	O96017	543 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	IL1A	P01583	271 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	MAP2K4	P45985	399 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF137P	P52743	207 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CRISP1	P54107	249 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NAA20	P61599	178 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TPM4	P67936	248 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LTC4S	Q16873	150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	SORT1	Q99523	831 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	REG1A	P05451	166 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CX3CR1	P49238	355 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	EMX2	Q04743	252 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PBK	Q96KB5	322 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A0J9YXV3	536 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PROP1	O75360	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	HOXA5	P20719	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	DUSP1	P28562	367 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CRABP1	P29762	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms