RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 LINC00596Q86U02 117 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 SPERTQ8NA61 448 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 BPIFCQ8NFQ6 507 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 MUCL1Q96DR8 90 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 C18orf12Q96KH6 178 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 OR51I2Q9H344 312 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 PLK3Q9H4B4 646 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 TINAGQ9UJW2 476 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 A0A0G2JNJ9 132 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 BMP5P22003 454 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 MPV17P39210 176 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 LGI3Q8N145 548 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 Q9UFV3 132 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-204ENST00000476231 BSNQ9UPA5 3926 aa16.21■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 K7EPK0 472 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 JTBO76095 146 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 SRPXP78539 464 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 BTN1A1Q13410 526 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TOMM40LQ969M1 308 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 RHOFQ9HBH0 211 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 MMP26Q9NRE1 261 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 LRP5LA4QPB2 252 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 E5RGE8 158 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 J3QT63 122 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 SYNGR1O43759 233 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 NAPSAO96009 420 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 APOC3P02656 99 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 GLAP06280 429 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 OR5AC1P0C628 307 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 KITLGP21583 273 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 HERV-K104P61576 105 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ZNF273Q14593 569 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TMED6Q8WW62 240 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 SMIM8Q96KF7 97 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 NSG2Q9Y328 171 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ATMQ13315 3056 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TMEM218A2RU14 115 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ID4P47928 161 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 RND3P61587 244 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 OR8G5Q8NG78 346 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 DYRK2Q92630 601 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 Q9N2K0 584 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 PPYP01298 95 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 CTXN2P0C2S0 81 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ZNF83P51522 516 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 GPR157Q5UAW9 335 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 BRICD5Q6PL45 260 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 Q6ZPA2 131 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 ELOVL5Q9NYP7 299 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TMEM210A6NLX4 147 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 DUSP1P28562 367 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 GCH1P30793 250 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 FXYD4P59646 89 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 KLRB1Q12918 225 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 OR8G1Q15617 311 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 C10orf91Q5T1B1 145 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 BATF2Q8N1L9 274 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 M0R1B8 84 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 DIRAS3O95661 229 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 C1QTNF9P0C862 333 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 AADACP22760 399 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 KIR2DS4P43632 304 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 SULT1A2P50226 295 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 BLOC1S1P78537 153 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 FAM27E3Q08E93 113 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 IL13RA2Q14627 380 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 KIR2DS1Q14954 304 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-204ENST00000476231 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms