RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RP2O75695 350 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF44P15621 663 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR52W1Q6IF63 320 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 Q6P435 159 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CHST6Q9GZX3 395 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HES4Q9HCC6 221 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 POLQO75417 2590 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 COL8A2P25067 703 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GATA4P43694 442 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ARFRP1Q13795 201 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 Q6ZPA2 131 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GPX8Q8TED1 209 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ST8SIA4Q92187 359 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NRGNQ92686 78 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DSCAMO60469 2012 aa15.18■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GW55 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RBBP9O75884 186 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR2H2O95918 312 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CSF1P09603 554 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MZT1Q08AG7 82 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LIME1Q9H400 295 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DUX4Q9UBX2 424 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 A0A0A6YYH2 397 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 A6NJ64 397 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SRRM5B3KS81 715 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DEGS1O15121 323 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LHBP01229 141 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MELTFP08582 738 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CD177Q8N6Q3 437 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.17■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PSPNO60542 156 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PDCD6O75340 191 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CD55P08174 381 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ADH4P08319 380 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FGF2P09038 288 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SELLP14151 372 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FUT3P21217 361 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TMUB2Q71RG4 321 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RNF7Q9UBF6 113 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HAND1O96004 215 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PSG2P11465 335 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.16■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TNFRSF1AP19438 455 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 AMY2BP19961 511 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GABRA2P47869 451 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NEK7Q8TDX7 302 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00052Q96N35 136 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CD3DP04234 171 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LPLP06858 475 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF146Q15072 292 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FAM90A1Q86YD7 464 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 Q8IYB0 196 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FGFRL1Q8N441 504 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR2AK2Q8NG84 335 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DIRC2Q96SL1 478 aa15.15■□□□□ 0.02
ATG4B-217ENST00000475693 EGLN1Q9GZT9 426 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms