RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471409.1

USP9Y-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 Y-linked, human

TSL 2

Gene USP9Y, Length 2,410 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9Y-204	ENST00000471409	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SERPINI1	Q99574	410 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	MED18	Q9BUE0	208 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	COX11	Q9Y6N1	276 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409		A0A087WUJ7	227 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FAM159B	A6NKW6	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409		F6UB75	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	RDH16	O75452	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	STK16	O75716	305 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	UPK1B	O75841	260 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	LALBA	P00709	142 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	CD34	P28906	385 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	UBE2E1	P51965	193 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	DSCR9	P59020	149 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PFN3	P60673	137 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ZNF146	Q15072	292 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OR7A5	Q15622	319 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PEX26	Q7Z412	305 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FTMT	Q8N4E7	242 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FGF14	Q92915	247 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	GGACT	Q9BVM4	153 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	MND1	Q9BWT6	205 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PARL	Q9H300	379 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OR51I1	Q9H343	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ASTN1	O14525	1302 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	C5orf58	C9J3I9	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SLC17A2	O00624	439 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SNAP91	O60641	907 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	GADD45G	O95257	159 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SLC2A10	O95528	541 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OR5G3	P0C626	314 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	CYBA	P13498	195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	GZMH	P20718	246 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	MAP2K4	P45985	399 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	GALR1	P47211	349 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	DNAJB13	P59910	316 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	RHOB	P62745	196 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OPN5	Q6U736	354 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	EPGN	Q6UW88	154 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	TMEM54	Q969K7	222 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	GPER1	Q99527	375 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FBN3	Q75N90	2809 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	FAM186A	A6NE01	2351 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	CACNA1H	O95180	2353 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP9Y-204	ENST00000471409	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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