RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 CTSSP25774 331 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVS71-1P61550 626 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 CLN3Q13286 438 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF787Q6DD87 383 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 OSR2Q8N2R0 312 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.66□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 FGF21Q9NSA1 209 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 DKKL1Q9UK85 242 aa11.66□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 SPINK2P20155 84 aa11.65□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 SOX15O60248 233 aa11.65□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.65□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.64□□□□□ -0.55
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR2M3Q8NG83 312 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10A7Q8NGE5 316 aa11.64□□□□□ -0.55
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SH3BP1-206ENST00000469947 EXT1Q16394 746 aa11.63□□□□□ -0.55
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SH3BP1-206ENST00000469947 FRYLO94915 3013 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 DHHO43323 396 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 PDCD6O75340 191 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 NRASP01111 189 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 TCN2P20062 427 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC10A1Q14973 349 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP1-206ENST00000469947 NMSQ5H8A3 153 aa11.63□□□□□ -0.55
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