RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	AQP3	Q92482	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	METTL9	Q9H1A3	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB22A	Q9UL26	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A0A6YYH2	397 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A6NJ64	397 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		M0R1W7	72 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	KDM4B	O94953	1096 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CYB5A	P00167	134 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM225B	P0DP42	221 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TNFSF8	P32971	234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	KLRD1	Q13241	179 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		Q8IYB0	196 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RFT1	Q96AA3	541 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	S100A13	Q99584	98 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CST11	Q9H112	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1W2PRD5	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1W2PRF3	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1W2PRM7	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		H3BUX3	64 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RGS5	O15539	181 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	HPGDS	O60760	199 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SCGN	O76038	276 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	IGKV1D-12	P01611	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	AMY2B	P19961	511 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DLX1	P56177	255 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	LOXL3	P58215	753 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	IKZF1	Q13422	519 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	STUM	Q69YW2	141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	LAX1	Q8IWV1	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PNKD	Q8N490	385 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DTX3	Q8N9I9	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MRAP	Q8TCY5	172 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	S100Z	Q8WXG8	99 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SOST	Q9BQB4	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB18	Q9NP72	206 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	AKR7A2	O43488	359 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PGA5	P0DJD9	388 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ELK1	P19419	428 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	UNC119	Q13432	240 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RSU1	Q15404	277 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	AANAT	Q16613	207 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SEH1L	Q96EE3	360 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SSX3	Q99909	188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TM2D1	Q9BX74	207 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ING4	Q9UNL4	249 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	CDIPT	O14735	213 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	GTF2F2	P13984	249 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	MNDA	P41218	407 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF45	Q02386	682 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB12	Q6IQ22	244 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	POC1A	Q8NBT0	407 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM104	Q8NE00	496 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TSSC4-208	ENST00000467308	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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