RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 LIPCP11150 499 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PVRP15151 417 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 GPX2P18283 190 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 GABRR2P28476 465 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 IL2RGP31785 369 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CCKARP32238 428 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR3A4PP47883 348 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SSR4P51571 173 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 AKR1C2P52895 323 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 NDUFA6P56556 154 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 S100A10P60903 97 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 UBA52P62987 128 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SRPXP78539 464 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ACVR1Q04771 509 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 LTBQ06643 244 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ST3GAL3Q11203 375 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PSG5Q15238 335 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF585BQ52M93 769 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM128Q5BJH2 165 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 MS4A13Q5J8X5 152 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CPTPQ5TA50 214 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF549Q6P9A3 640 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXW12Q6X9E4 464 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 Q6ZSR3 168 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 HIST2H3AQ71DI3 136 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 FA2HQ7L5A8 372 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 C16orf82Q7Z2V1 217 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 NIT1Q86X76 327 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 DOLPP1Q86YN1 238 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 RIMKLAQ8IXN7 391 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 KIR2DL5AQ8N109 375 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 FTMTQ8N4E7 242 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF439Q8NDP4 499 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHDC9Q8NEP7 349 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 LFNGQ8NES3 379 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR2T33Q8NG76 320 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR10AD1Q8NGE0 317 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR56A4Q8NGH8 313 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR52E4Q8NGH9 312 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR9I1Q8NGQ6 314 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR6N2Q8NGY6 317 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR1P1Q8NH06 330 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR51Q1Q8NH59 317 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR1S1Q8NH92 325 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ISOC2Q96AB3 205 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PIK3IP1Q96FE7 263 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PYURFQ96I23 114 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 BTF3L4Q96K17 158 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC35G5Q96KT7 338 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 LXNQ9BS40 222 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SEC11CQ9BY50 192 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ARL6Q9H0F7 186 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 DEFB129Q9H1M3 183 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 NOX3Q9HBY0 568 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM38BQ9NVV0 291 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CLN6Q9NWW5 311 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 HRASLS2Q9NWW9 162 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 NUDT4Q9NZJ9 180 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 PRODH2Q9UF12 536 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 VPREB3Q9UKI3 123 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ORC6Q9Y5N6 252 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 V9GYY9 64 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 UBR3Q6ZT12 1888 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa2.79□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SLIT3O75094 1523 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 C21orf140B9A014 251 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 F5H768 121 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 MANBAO00462 879 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CCL21O00585 134 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 HCRTR1O43613 425 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 MFSD11O43934 449 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 FGF17O60258 216 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC19A2O60779 497 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 STK16O75716 305 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF432O94892 652 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 VENTXO95231 258 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 CLIC3O95833 236 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A27O95847 323 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD28-205ENST00000460278 AMBPP02760 352 aa2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms