RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 E9PCH4 1651 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ASPDHA6ND91 283 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM212A6NML5 194 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FNDC10F2Z333 226 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A10O95528 541 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HOXC9P31274 260 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 YAF2Q8IY57 180 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR51H1Q8NH63 302 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ACER1Q8TDN7 264 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR8B2Q96RD0 313 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CHST6Q9GZX3 395 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OSER1Q9NX31 292 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf118A6NHY6 69 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRACP01848 142 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GPX2P18283 190 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 IL11P20809 199 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SRIP30626 198 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PPICP45877 212 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZXDBP98169 803 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF585BQ52M93 769 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRNP1Q6NT89 227 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PP6455Q8WZ26 134 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM19Q96E16 107 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF442Q9H7R0 627 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LYRM4Q9HD34 91 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NECAP2Q9NVZ3 263 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 JPT1Q9UK76 154 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ABCC3O15438 1527 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CPS1P31327 1500 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DIP2AQ14689 1571 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ATP7AQ04656 1500 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RNF222A6NCQ9 220 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GYPBP06028 91 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FCGR3AP08637 254 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 BTG2P78543 158 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ARL16Q0P5N6 197 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR1F12Q8NHA8 337 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CALHM2Q9HA72 323 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 H3BRM9 83 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CTAG2O75638 210 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LIMS3P0CW19 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LIMS4P0CW20 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS7P47929 136 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CASP7P55210 303 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN15P56746 228 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MALLQ13021 153 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF611Q8N823 705 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NEUROG1Q92886 237 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C20orf173Q96LM9 149 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MGST2Q99735 147 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RNF208Q9H0X6 261 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP13Q9UII6 198 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ABCA9Q8IUA7 1624 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R3DO95685 299 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 UCNP55089 124 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RTP5Q14D33 572 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SGCBQ16585 318 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB115Q30KQ5 88 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RETNQ9HD89 108 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CEP152O94986 1710 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KIF20BQ96Q89 1820 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 WNT11O96014 354 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HOXC6P09630 235 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SNHG28P0DPA3 235 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CCL23P55773 120 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KIR3DS1Q14943 382 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MORN2Q502X0 79 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LAIR2Q6ISS4 152 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms