RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TECTBQ96PL2 329 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OR51I2Q9H344 312 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 GAB2Q9UQC2 676 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 SSSCA1O60232 199 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TOMM40O96008 361 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 FCGR2AP12318 317 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 AADACP22760 399 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 RUNX1Q01196 453 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 RUNX3Q13761 415 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 Q6ZPA2 131 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF525Q8N782 197 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 A0A1B0GV50 99 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 IRF2P14316 349 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 COTL1Q14019 142 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 MORN2Q502X0 79 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 FAM57BQ71RH2 274 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 MED29Q9NX70 200 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PPQ1 181 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 FAM221AA4D161 298 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 HS3ST1O14792 307 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 REG1AP05451 166 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TDGF1P13385 188 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CD82P27701 267 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 HERV-K104P61576 105 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 GNB2P62879 340 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 SSX7Q7RTT5 188 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF695Q8IW36 515 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TOMM40LQ969M1 308 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 LRP5LA4QPB2 252 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ADAM20O43506 726 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 PDCD6O75340 191 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TIAF1O95411 115 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OPN1LWP04000 364 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CTRLP40313 264 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CLRN1P58418 232 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 PPP1CAP62136 330 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF154Q13106 437 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 UEVLDQ8IX04 471 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TMEM54Q969K7 222 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 DEFB118Q96PH6 123 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 DIRC2Q96SL1 478 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ONECUT2O95948 504 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TNFP01375 233 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 NEK7Q8TDX7 302 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 PGAM5Q96HS1 289 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 OXGR1Q96P68 337 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CHST1O43916 411 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 LILRA1O75019 489 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF737O75373 536 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 HLA-HP01893 362 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CTXN2P0C2S0 81 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ASCL1P50553 236 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 CEBPGP53567 150 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 Q0VG73 95 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 PRSS8Q16651 343 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-208ENST00000441439 TMEM123Q8N131 208 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms