RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NUPR1O60356 82 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFSF13O75888 250 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CTLA4P16410 223 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SFTPDP35247 375 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GALR1P47211 349 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR3A4PP47883 348 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGPP57054 158 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MMDQ15546 238 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LYG1Q8N1E2 194 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4C3Q8NH37 302 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52N5Q8NH56 324 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 BOD1Q96IK1 185 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR27Q9NS67 375 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF23A1L1A6 192 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB8O95169 186 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FASLGP48023 281 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H3AP68431 136 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TLE1Q04724 770 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 EGR4Q05215 589 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 IL13RA2Q14627 380 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 EMC4Q5J8M3 183 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5B12Q96R08 314 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFSF14O43557 240 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CST7O76096 145 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CSNK1A1P48729 337 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAT2Q10469 447 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GNMTQ14749 295 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RTP5Q14D33 572 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 STPG4Q8N801 248 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GW15 77 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLON5A6NGN9 336 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 H7BYZ3 331 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 HBE1P02100 147 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CMPK1P30085 196 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF92Q03936 586 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1FQ16864 119 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PMS2CLQ68D20 193 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LGI3Q8N145 548 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM10Q96HG1 83 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS25Q9BRG1 176 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SERINC4A6NH21 518 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QZ24 198 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ISG15P05161 165 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5G3P0C626 314 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP1P28562 367 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM3P40198 252 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ID1P41134 155 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LCN15Q6UWW0 184 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CALHM1Q8IU99 346 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF524Q96C55 264 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 VAMP8Q9BV40 100 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 VCANP13611 3396 aa7.27□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS37A4D1T9 235 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms