RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 OR56B4Q8NH76 319 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 STMN2Q93045 179 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TMEM106AQ96A25 262 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 IFT22Q9H7X7 185 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 IL36GQ9NZH8 169 aa14.68□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 A0A1W2PPE3 182 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 C15orf65H3BRN8 121 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 CEACAM3P40198 252 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 PRRX1P54821 245 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 CCDC58Q4VC31 144 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 DRAM1Q8N682 238 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 GPR148Q8TDV2 347 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TOMM40LQ969M1 308 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 GPER1Q99527 375 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 HTR3BO95264 441 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 GNG10P50151 68 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 RSU1Q15404 277 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 DDI2Q5TDH0 399 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 REC114Q7Z4M0 266 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 UBALD1Q8TB05 177 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 SMIM19Q96E16 107 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.66□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 PIN1P1O15428 100 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 DCKP27707 260 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 LYPD6Q86Y78 171 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 OSR2Q8N2R0 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 MRAPQ8TCY5 172 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 RPEQ96AT9 228 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.65□□□□□ -0.06
SGO1-208ENST00000437051 COL7A1Q02388 2944 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 GPX5O75715 221 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 MNDAP41218 407 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 KCNJ3P48549 501 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 LOXL3P58215 753 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 KRTAP10-11P60412 298 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 OR52N1Q8NH53 320 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 GHSRQ92847 366 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 RDH12Q96NR8 316 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ING4Q9UNL4 249 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.64□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 LINC01548A6NM66 108 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 K7EIL1 84 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 CD33P20138 364 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 SERPINA2P20848 420 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 BDKRB2P30411 391 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ARHGDIBP52566 201 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 MADCAM1Q13477 382 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 EBI3Q14213 229 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ZNF329Q86UD4 541 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 Q8N6K4 173 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 SGCDQ92629 289 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 METTL9Q9H1A3 318 aa14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGO1-208ENST00000437051 SLC31A2O15432 143 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms