RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 MPV17P39210 176 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 NAAAQ02083 359 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 IGSF11Q5DX21 431 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 LGI3Q8N145 548 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 HES4Q9HCC6 221 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR13Q9NZ81 148 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUX4Q9UBX2 424 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-DRB3P79483 266 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 H0YIZ8 118 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 OR5AC1P0C628 307 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ALKAL2Q6UX46 152 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 OR5T2Q8NGG2 359 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 C18orf12Q96KH6 178 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 MPTX1A8MV57 137 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF843Q8N446 348 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SH2D1BO14796 132 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SPDEFO95238 335 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SCTP09683 121 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF44P15621 663 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUSP1P28562 367 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GCH1P30793 250 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 HERPUD1Q15011 391 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR31O00270 319 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 MPPED1O15442 326 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 WNT2P09544 360 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB32Q13637 225 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GLS2Q9UI32 602 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 HS3ST1O14792 307 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 MLNRO43193 412 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 NXPH2O95156 264 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2H2O95918 312 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RLN2P04090 185 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RDH5Q92781 318 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 CDIPTO14735 213 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GNRHRP30968 328 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SMCO1Q147U7 214 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TAAR5O14804 337 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 LMO1P25800 156 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TINAGQ9UJW2 476 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 ESPL1Q14674 2120 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 HSPB6O14558 160 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 BET1O15155 118 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR7Q8TB68 274 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM56Q96MV1 263 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGMQ9H3S5 423 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms