RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.69■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC35A2P78381 396 aa16.68■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 RSU1Q15404 277 aa16.68■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 OR8H3Q8N146 312 aa16.68■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 S100A14Q9HCY8 104 aa16.67■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.67■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 OR56B4Q8NH76 319 aa16.66■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.65■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.65■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.65■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.65■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 METTL9Q9H1A3 318 aa16.65■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
LIMS1-208ENST00000428064 ST3GAL6Q9Y274 331 aa16.65■□□□□ 0.26
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LIMS1-208ENST00000428064 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 PPP3R1P63098 170 aa16.64■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 OGG1O15527 345 aa16.63■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 HTR3BO95264 441 aa16.63■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A1P30531 599 aa16.63■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.63■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.63■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 OR52N1Q8NH53 320 aa16.63■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.63■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.62■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16.62■□□□□ 0.25
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LIMS1-208ENST00000428064 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.62■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf65H3BRN8 121 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B6O14756 317 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GPX5O75715 221 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-7P01780 117 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGHG2P01859 326 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 LTC4SQ16873 150 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 Q3ZCU0 254 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00311Q8N616 119 aa16.61■□□□□ 0.25
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