RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13C3Q8NGS6 347 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFKQ969G6 155 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF25Q9UIL4 384 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR1AP08908 422 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTNR1BP49286 362 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNG10P50151 68 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR9P51686 369 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTC4SQ16873 150 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX38Q6PEX7 206 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8U1Q8NH10 309 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR25Q96S07 402 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABARAPL3Q9BY60 117 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP4M1O00189 453 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B6O14756 317 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A6O15403 523 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCKP08631 526 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM225BP0DP42 221 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB136Q30KP8 78 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5M8Q8NGP6 311 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10X1Q8NGY0 326 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP4S1Q9Y587 144 aa10.35□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01548A6NM66 108 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf84H3BNL1 204 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT1B1O43704 296 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFPL1O95159 310 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FASP25445 335 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSTR5P35346 364 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR12P47775 334 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAX5Q02548 391 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EBI3Q14213 229 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KISS1Q15726 138 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELP2Q6IA86 826 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFESDQ8TAC1 157 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNIH3Q8TBE1 160 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPE3 182 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAPL1A0PJW8 107 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4C45A6NMZ5 311 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QRE1 110 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECI1P42126 302 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REG1BP48304 166 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ3P48549 501 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR50Q13585 617 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL13RA2Q14627 380 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DS1Q14954 304 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF691Q5VV52 312 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPCAT4Q643R3 524 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N6K4 173 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXT1Q8NFP0 134 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNFT2Q96EX2 444 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PELI1Q96FA3 418 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GON7Q9BXV9 100 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCG5Q9H222 651 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYSTQ99698 3801 aa10.33□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCRL2O00421 344 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELANEP08246 267 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms