RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 HS3ST1O14792 307 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 OR4E1P0C645 316 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DUSP1P28562 367 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PRDX2P32119 198 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DHODHQ02127 395 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 KCNJ8Q15842 424 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 RDH5Q92781 318 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SNX22Q96L94 193 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 LURAP1Q96LR2 239 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 GCM1Q9NP62 436 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 RAB9BQ9NP90 201 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0B4J2A0 478 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 OR2AT4A6NND4 320 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 FABP7O15540 132 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SSNA1O43805 119 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 TK1P04183 234 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PSG2P11465 335 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PPOXP50336 477 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DRB3P79483 266 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CBX3Q13185 183 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PDCD1Q15116 288 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 BRICD5Q6PL45 260 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF561Q8N587 486 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 VSIG4Q9Y279 399 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 OOEPA6NGQ2 149 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SIRPB1O00241 398 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MGST3O14880 152 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFA2O43678 99 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 HPXP02790 462 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 GSTT2P0CG29 244 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ANXA3P12429 323 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-GP17693 338 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZBTB25P24278 435 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CARTPTQ16568 116 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MST1LQ2TV78 715 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CR1LQ2VPA4 569 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 C4orf46Q504U0 113 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf183Q5T699 404 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 LYG2Q86SG7 212 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 BATF2Q8N1L9 274 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 MOB3AQ96BX8 217 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SDSLQ96GA7 329 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms