RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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PKP4-201ENST00000389757 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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PKP4-201ENST00000389757 SYNGR1O43759 233 aa8.9□□□□□ -0.98
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