RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 FUT3P21217 361 aa20.49■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 MAS1LP35410 378 aa20.49■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF611Q8N823 705 aa20.49■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 TECTBQ96PL2 329 aa20.49■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM222Q9H0R3 208 aa20.49■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 TRDCB7Z8K6 153 aa20.48■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 NPBWR2P48146 333 aa20.48■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.48■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.48■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 C5orf49A4QMS7 147 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ARG1P05089 322 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 OR13C7P0DN81 318 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 MEOX1P50221 254 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A26Q70HW3 274 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 OR8G5Q8NG78 346 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 POM121Q96HA1 1249 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PPE2 198 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 NKX2-6A6NCS4 301 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 PITX3O75364 302 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SOHLH1Q5JUK2 328 aa20.47■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 FABP1P07148 127 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SP1P08047 785 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAM5Q6NVV9 412 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SUMF2Q8NBJ7 301 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 MDS2Q8NDY4 140 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM56Q96MV1 263 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SPIN2AQ99865 258 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM24AA6NFZ4 105 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF724A8MTY0 619 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ASCL1P50553 236 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 OR2G3Q8NGZ4 309 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 APH1AQ96BI3 265 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ABHD14BQ96IU4 210 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 DOCK7Q96N67 2140 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.46■□□□□ 0.87
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM186AA6NE01 2351 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 IGSF23A1L1A6 192 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V0CP27449 155 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 DPPA2Q7Z7J5 298 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1B0GV50 99 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 OR8U8P0C7N1 319 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 GNRHRP30968 328 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 IGSF11Q5DX21 431 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 Q6ZS49 121 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 C1QL4Q86Z23 238 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RARRES2Q99969 163 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A31Q9H0C2 315 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 BTBD17A6NE02 478 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RBFOX3A6NFN3 312 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS23P62266 143 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDX4Q13162 271 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF695Q8IW36 515 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 NIT2Q9NQR4 276 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 LINC00587B1AMM8 73 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 AP4M1O00189 453 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR37O15354 613 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 NGFP01138 241 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 OR2B8PP59922 312 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 RND3P61587 244 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 HIKESHIQ53FT3 197 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D26Q86UD7 250 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 YPEL4Q96NS1 127 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A10PA6NDY2 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A18PA6NE21 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A16PA6NEW6 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A7PA6NKC0 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A22PA8MWA6 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A12PA8MX19 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA12AO43301 675 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-201ENST00000369862 OR2C1O95371 312 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms