RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM171Q8WVE6 324 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 Q8WTZ3 238 aa19.58■□□□□ 0.73
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PTPRM-201ENST00000332175 C11orf94C9JXX5 98 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 PSG2P11465 335 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 P2RY1P47900 373 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf113Q5VZT2 155 aa19.58■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa19.55■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 PPIAL4DF5H284 164 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 PPIAL4FP0DN26 164 aa19.55■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 C10orf111Q8N326 155 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 OR1L6Q8NGR2 347 aa19.55■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 PPIAL4AQ9Y536 164 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A9Q9NRM0 540 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 SYNGR1O43759 233 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 FTH1P19P0C7X4 201 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 NPAS1Q99742 590 aa19.54■□□□□ 0.72
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