RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 FPR2P25090 351 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZNF738Q8NE65 137 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 S100A8P05109 93 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 VDAC1P21796 283 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 EMP1P54849 157 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RANP62826 216 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NTMQ9P121 344 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 UQCRFS1P47985 274 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 OR4S2Q8NH73 311 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RNF24Q9Y225 148 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PF4P02776 101 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SPSB1Q96BD6 273 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ALS2Q96Q42 1657 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC17A2O00624 439 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 EDIL3O43854 480 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CHST1O43916 411 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 KCNJ3P48549 501 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HCP5Q6MZN7 132 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CCL19Q99731 98 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-48P01763 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HTN3P15516 51 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PMELP40967 661 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ASAH1Q13510 395 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SSX8Q7RTT4 187 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 OR10C1Q96KK4 312 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 FAM157CP0CG43 387 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NKG7Q16617 165 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 FAHD1Q6P587 224 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MDP1Q86V88 176 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MZB1Q8WU39 189 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LEAP2Q969E1 77 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 GSX2Q9BZM3 304 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NAA60Q9H7X0 242 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.3□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GUH1 482 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ADAP1O75689 374 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ISOC2Q96AB3 205 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PERPQ96FX8 193 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RASL10BQ96S79 203 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 WNT16Q9UBV4 365 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TRDCB7Z8K6 153 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DAOP14920 347 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 WNT3P56703 355 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TUBA4BQ9H853 241 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 GCGP01275 180 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MGAT2Q10469 447 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CCL13Q99616 98 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 KLK15Q9H2R5 256 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LRP5O75197 1615 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZFPL1O95159 310 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HERVK_113P61574 105 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 GAPTQ8N292 157 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 WBP1LQ9NX94 342 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HERPUD1Q15011 391 aa9.29□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CST4P01036 141 aa9.28□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ID1P41134 155 aa9.28□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CLDN18P56856 261 aa9.28□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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