RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	RBBP9	O75884	186 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	FUT3	P21217	361 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	FGFRL1	Q8N441	504 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PECR	Q9BY49	303 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CUBN	O60494	3623 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM235	A6NFC5	223 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	TMPRSS2	O15393	492 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	GNB3	P16520	340 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC6A1	P30531	599 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	OR3A1	P47881	315 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ACTB	P60709	375 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ACTG1	P63261	375 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	GUCA2A	Q02747	115 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CHST4	Q8NCG5	386 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DYRK2	Q92630	601 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CHST6	Q9GZX3	395 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PPA2	Q9H2U2	334 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	GLS2	Q9UI32	602 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	HSF4	Q9ULV5	492 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SIGLEC5	O15389	551 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ADAM20	O43506	726 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	BTC	P35070	178 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ST8SIA4	Q92187	359 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CENPX	A8MT69	81 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	CSF1	P09603	554 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNJ8	Q15842	424 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF561	Q8N587	486 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SERPINE3	A8MV23	424 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	IL13RA1	P78552	427 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PLA1A	Q53H76	456 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ENKUR	Q8TC29	256 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	UBE2QL1	A1L167	161 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780		K7N7A8	449 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	NDUFA2	O43678	99 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SSX5	O60225	188 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SPIC	Q8N5J4	248 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	SNX22	Q96L94	193 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	AK3	Q9UIJ7	227 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FAM53B-201	ENST00000280780	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TK1	P04183	234 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	RCVRN	P35243	200 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	COQ2	Q96H96	371 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	HEXA	P06865	529 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	WNT2	P09544	360 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	GRK1	Q15835	563 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780		Q6ZPA2	131 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MED30	Q96HR3	178 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	DVL1	O14640	695 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	GLA	P06280	429 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NAT1	P18440	290 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CBX5	P45973	191 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	GNG2	P59768	71 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	LMO4	P61968	165 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NEK7	Q8TDX7	302 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		18.5	■□□□□ 0.55

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