RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 UCP3P55916 312 aa18.34■□□□□ 0.53
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ODC1-201ENST00000234111 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.3■□□□□ 0.52
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ODC1-201ENST00000234111 RASL10BQ96S79 203 aa18.3■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 C20orf144Q9BQM9 153 aa18.3■□□□□ 0.52
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ODC1-201ENST00000234111 EFNA3P52797 238 aa18.29■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.29■□□□□ 0.52
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ODC1-201ENST00000234111 SCGB1C1Q8TD33 95 aa18.29■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 TNFSF13O75888 250 aa18.29■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 MDH2P40926 338 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 NPBWR2P48146 333 aa18.29■□□□□ 0.52
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ODC1-201ENST00000234111 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 TYMSP04818 313 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 RBX1P62877 108 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 TESK1Q15569 626 aa18.28■□□□□ 0.52
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ODC1-201ENST00000234111 ALKBH4Q9NXW9 302 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 TAAR3PQ9P1P4 343 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 ZFP30Q9Y2G7 519 aa18.28■□□□□ 0.52
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