RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 M0R2Z0 102 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HPRT1P00492 218 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MAGEA5P43359 124 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CLDN18P56856 261 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PSG6Q00889 435 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPV9 198 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C11orf94C9JXX5 98 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PPYP01298 95 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CRHP06850 196 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 STAG3L3P0CL85 134 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 BSXQ3C1V8 233 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IGSF11Q5DX21 431 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FAM78BQ5VT40 261 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A087X0M5 115 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GX30 115 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C16orf97H3BN30 126 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RD3LP0DJH9 198 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMEM33P57088 247 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZN92 141 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A22Q9H936 323 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C5orf52A6NGY3 159 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SYNGR1O43759 233 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SMPD2O60906 423 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KIR3DL2P43630 455 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SPINK14Q6IE38 97 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 DYRK2Q92630 601 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MPDU1O75352 247 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SEC11BP0C7V7 166 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PSMB2P49721 201 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TEX30Q5JUR7 227 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TEPPQ6URK8 271 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SHISA5Q8N114 240 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SYT8Q8NBV8 401 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 COPS9Q8WXC6 57 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SCMH1Q96GD3 660 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.33□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CDC42EP2O14613 210 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 GAPTQ8N292 157 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NAGKQ9UJ70 344 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SCO1O75880 301 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FAM87AP0C7U9 286 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 P2RY6Q15077 328 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CD226Q15762 336 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 GAB4Q2WGN9 574 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZG16BQ96DA0 208 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PR80 420 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 H0Y980 276 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MFNGO00587 321 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FFAR1O14842 300 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMPRSS2O15393 492 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NDUFA2O43678 99 aa6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IGHMP01871 453 aa6.32□□□□□ -1.4
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